2 августа 2012 года Министерство внутренних дел Республики Польша и Европейская комиссия подписали контракт реализации Целевой инициативы Пражского процесса и проекта «Поддержка реализации Пражского процесса и его плана действий».
Основной задачей проекта, реализуемого совместно Польшей (являющейся лидером и координатором Целевой инициативы), Чешской Республикой, Германией, Венгрией, Румынией, Словакией, Швецией и Международным Центром по Развитию Миграционной Политики (ICMPD), выполняющим функцию Секретариата Пражского процесса, является укрепление сотрудничества по вопросам миграции и убежища между государствами-участниками Пражского процесса (ЕС и страны шенгенского соглашения, Восточное партнерство, западные Балканы, Центральная Азия, Россия и Турция). В рамках проекта происходит работа над укреплением экспертного диалога и обмена информацией между участниками в большей степени через развитие сотрудничества между национальными координаторами Пражского процесса и организацию тематических встреч экспертного уровня. База знаний, состоящая из миграционных профилей, описывающих миграционную ситуацию государств-участников Пражского процесса, постоянно расширяется. Кроме того, ведется работа над обновлением Интерактивной онлайн карты восточных миграционных путей (и-карта).
Реализация семи пилотных проектов в областях законной и незаконной миграции, миграции и развития, а также убежища и международной защиты представляет еще одну важную задачу Целевой инициативы Пражского процесса.
Первые четыре пилотных проекта были реализованы в рамках Целевой инициативы Пражского процесса в период с 2012 по 2014 годы. Подписание Дополнительного соглашения в декабре 2013 года дало возможность разработать концепцию трех новых Пилотных проектов, реализуемых с 2014 по 2015 годы. Польша совместно с Румынией и Словакией были ответственны за Пилотный проект 1 по незаконной миграции; Венгрия - за Пилотный проект 2 по законной миграции; Чешская Республика - за Пилотный проект 3 по миграции и развитию; Швеция и Германия возглавляли Пилотный проект 4 по убежищу и международной защите. Основываясь на проверенных моделях сотрудничества, Пилотный проект 5 по незаконной миграции возглавляется Польшей при поддержке Румынии, Пилотный проект 6 по трудовой миграции - Чешской республикой и Венгрией, а Пилотный проект 7 по убежищу и международной защите вновь находится под эгидой Швеции и Германии.
Проводимые в рамках пилотных проектов мероприятия координируются с работой Панели Восточного партнерства по миграции и убежищу, секретариат которой софинансируется Целевой инициативой Пражского процесса.
Изначально проект ЦИ ПП был рассчитан на 3 года. 23 декабря 2013 года был подписано Дополнительное соглашение к генеральному контракту, в рамках которого проект был продлен до 42 месяцев, т.е. до января 2016 года, а бюджет был увеличен на 20%. Благодаря подписанию второго Дополнительного соглашения в июле 2015 года проект был еще раз продлен и должен быть реализован до 31 декабря 2016 года.
Европейская комиссия выделила на Целевую инициативу Пражского процесса 3 миллиона евро. В декабре 2013 года общая сумма финансирования увеличилась до 3,6 миллионов.