Профессор Райнер Мюнц был советником по миграции и демографии в Центре европейской стратегической политики (EPSC), внутреннем аналитическом центре, консультировавшем президента Европейской комиссии Й.К. Юнкера во время его пребывания в должности (2014-2019).
До прихода в Европейскую комиссию Райнер Мюнц в период с 2005 по 2015 год был главой отдела исследований и разработок в Erste Group, центрально-европейском розничном банке со штаб-квартирой в Вене. Он был старшим научным сотрудником европейского аналитического центра Bruegel (Брюссель), Гамбургского института международной экономики (HWWI) и Института миграционной политики (MPI, Вашингтон, округ Колумбия). Он также работал консультантом в Европейском совете, ОЭСР и Всемирном банке.
До 2004 года Райнер Мюнц занимался академической карьерой, работая исследователем в Австрийской академии наук (1980-1992 годы) и на факультете математики финансов Венского технического университета (Вена) в 2002-2004 годах, а также был штатным профессором Университета Гумбольдта, Берлин, 1993-2003 гг.
Он также был приглашенным профессором в университетах Бамберга, Калифорнийском университете в Беркли, Американском университете в Каире (AUC), Франкфурте/ Массачусетсе, Иерусалимском университете в Клагенфурте, Санкт-Галлене (HSG), Вене и Цюрихе. В настоящее время он преподает в Австрийской дипломатической академии в Вене и Центральноевропейском университете (CEU)